CRISPR文库
CRISPR敲除文库通常用于功能缺失筛查。在这些筛选中,文库靶向的每个基因都存在多个gRNA。CRISPR敲除的效果不容易逆转,因为靶向基因序列被CRISPR突变。其他CRISPR筛选包括CRISPR 激活(CRISPRa)和抑制(CRISPRi)筛选。这些筛选使用催化死亡的dCas9来抑制或激活给定的基因,而无需直接的基因组修饰,因此效果是可逆的。
在选择文库时,请注意,一些文库载体含有Cas9(1质粒系统)而另一些则需要与表达Cas9的病毒共感染或在表达Cas9(2质粒系统)的细胞中使用。
knockout
CRISPR敲除文库旨在在整个基因组的靶基因中产生插入或缺失,使其失去功能,除非另有规定,否则文库的设计目标是整个基因组。为了限制假阳性或假阴性,每个文库包含文库靶向的每个基因的 多个gRNA。每个文库还包含非靶向对照gRNA。
ID
物种
靶向基因
每个基因的gRNA
总gRNA
备注
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
这个慢病毒基因组规模的CRISPR文库靶向人类基 囚组中所有约20500个蛋白质编码基因。该文库 分为9个子文库,由基因的生物学类别定义,每个 子文库都有自己的阴性对照。
101926 -101934
人类
变化(总计约20500)  
~10
变化
CRUSPR敲除文库
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
1000000121一1000000130
老鼠
变化(总计约20500)
~10
变化
CRUSPR敲除文库
伯杰实验室人类Paralog淘汰库(pgPEN)
描述
171172
人类
1030个基因对
8pgRNA/基因
16 pgRNA/对
33,170
CRUSPR敲除文库
人类表观遗传学基因敲除文库
描述
162256
人类
2,508
8
20,051
CRUSPR敲除文库
老鼠CRISPR代谢基因敲除文库
描述
160129
老鼠
2,865
8
22,909
CRUSPR敲除文库
激活
CRISPR激活文库使用gRNA引导与转录激活剂结合的dCos9靶向基因,从而激活其表达。您可以在我们的CRISPR指南页面上了解更多基于CRISPR的基因调控
ID
物种
靶向基因
每个基因的gRNA
总gRNA
备注
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
这个慢病毒基因组规模的CRISPR文库靶向人类基 囚组中所有约20500个蛋白质编码基因。该文库 分为9个子文库,由基因的生物学类别定义,每个 子文库都有自己的阴性对照。
101926 -101934
人类
变化(总计约20500)  
~10
变化
CRUSPR敲除文库
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
1000000121一1000000130
老鼠
变化(总计约20500)
~10
变化
CRUSPR敲除文库
伯杰实验室人类Paralog淘汰库(pgPEN)
描述
171172
人类
1030个基因对
8pgRNA/基因
16 pgRNA/对
33,170
CRUSPR敲除文库
人类表观遗传学基因敲除文库
描述
162256
人类
2,508
8
20,051
CRUSPR敲除文库
老鼠CRISPR代谢基因敲除文库
描述
160129
老鼠
2,865
8
22,909
CRUSPR敲除文库
抑制
CRISPR抑制文库使用gRNA引导与转录阻退物结合的dCas9靶向基因,阻断转录起始,从而抑制或敲低其表达。您可以在我们的CRISPR指南页面上了解更多基于CRISPR的基因调控。
ID
物种
靶向基因
每个基因的gRNA
总gRNA
备注
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
这个慢病毒基因组规模的CRISPR文库靶向人类基 囚组中所有约20500个蛋白质编码基因。该文库 分为9个子文库,由基因的生物学类别定义,每个 子文库都有自己的阴性对照。
101926 -101934
人类
变化(总计约20500)  
~10
变化
CRUSPR敲除文库
Bassik人类CRISPR敲除文库
描述
1000000121一1000000130
老鼠
变化(总计约20500)
~10
变化
CRUSPR敲除文库
伯杰实验室人类Paralog淘汰库(pgPEN)
描述
171172
人类
1030个基因对
8pgRNA/基因
16 pgRNA/对
33,170
CRUSPR敲除文库
人类表观遗传学基因敲除文库
描述
162256
人类
2,508
8
20,051
CRUSPR敲除文库
老鼠CRISPR代谢基因敲除文库
描述
160129
老鼠
2,865
8
22,909
CRUSPR敲除文库